手性分离效果是多种相互作用共同作用的结果。这些相互作用通过影响包埋复合物的形成，特殊位点与分析物的键合等而改变手性分离结果。由于这种作用力较微弱，因此需要仔细调节、优化流动相和温度以达到最佳分离效果。

　　手性色谱柱分类：

　　1类：通过氢键、π-π作用、偶级-偶级作用形成复合物。

　　2类：既有类型1中的相互作用，又存在包埋复合物。此类手性柱中典型的是由纤维素及其衍生物制成的手性柱。

　　3类：基于溶剂进入手性空穴形成包埋复合物。这类手性柱中最典型的是由Armstrong教授开发的环糊精型手性柱[2]，另外冠醚型手性柱和螺旋型聚合物，如聚（苯基甲基甲基丙烯酸酯）形成的手性柱也属于此类。

　　4类：基于形成非对映体的金属络合物，是由Davankov开发的手性分离技术，也称为手性配位交换色谱（CLEC）。

　　5类：蛋白质型手性柱。手性分离是基于疏水相互作用和极性相互作用实现。但是，随着由于市场上可选择的手性色谱柱越来越多，此分类系统有时很难将一些手性柱归纳进去。