凝胶色谱柱的填料是以刚性的球形硅胶为基质，在其表面通过共价键化学键合亲水团而成。色谱柱的填料具有高性能尺寸排阻色谱所需的性能，即低吸附性和良好的孔径分布；其pH适合范围为2.5～7.5，可以使用与水*互溶的有机溶剂，如乙腈、丙酮、甲醇或乙醇等。

 

　　凝胶色谱柱的填料是亲水而刚性，多孔球型，化学和机械性能都非常优异的聚合物。适用于以凝胶色谱的模式分析分离蛋白质、多肽、多糖、寡糖、DNA、RNA、水溶性的有机聚合物和其他水溶性大分子样品等。

 

　　凝胶色谱柱的应用也越来越广泛，使用过后也要对色谱柱进行保养，这样才能使它的使用寿命更长久。为了不使被测物质和杂质停留在色谱柱中，在每次的样品分析工作完成之后，都应及时地清洗色谱柱。

 

　　首先要用对被测样品洗脱能力强的溶剂来洗脱色谱柱，以分析工作中常用的反相色谱分析法为例，因其先流出的物质是极性大的物质，此时应用纯甲醇或使用异丙纯等极性稍弱的溶剂将吸附在柱内的极性小的物质洗脱下来，洗脱液的用量一般为柱体积的20倍即可。如果流动相是缓冲溶液，则应先用蒸馏水来冲洗色谱柱，以冲掉柱内的盐，然后再用合适的溶剂来冲洗。

 

　　如果色谱柱长期不用，仅用上述方法来处理就不行了，这时应使用色谱柱使用说明书中所指明的溶剂来充满色谱柱，凝胶柱则不能用水了，因柱内如果有微生物的生长则会使柱效降低，此时应用0.05%的NaNs水溶液(防腐剂)来冲洗色谱柱，再将色谱柱封严。色谱柱长期放置时，一定要将色谱柱的两端封严，以防止由于溶剂挥发而造成的柱填料干缩现象，因这可导致柱效的严重降低。